Где в церковнославянском слове стоит ударение — по тому, как это написано в самих книгах собрания. Вставьте текст, чтобы расставить знаки, или спросите про отдельное слово.
Словарь описательный, а не нормативный: он говорит, как слово размечено в собраниях и сколько раз, а не как правильно. Где книги расходятся — показываем оба написания и оставляем выбор вам.
Словарь собран из трёх источников: 182 812 основ из книжных чтений, 85 922 из песнопений, 138 629 из словаря церковнославянского — всего 293 891. Там, где слово знают хотя бы двое (95 276), они сходятся в 92 943 случаях. Те же данные отдаёт API.